Für alle Bereiche stehen modernste, hochauflösende Videoendoskope zur Verfügung. Es werden qualitätskontrollierte Verfahren zur Aufbereitung der Endoskope mit speziellen Waschmaschinen für Endoskope (entsprechend den Richtlinien des Robert Koch Instituts) angewendet.
Die Endoskope werden in vierteljährigen Abständen durch das Institut für Hygiene der Medizinischen Fakultät einer hygienisch-mikrobiologischen Kontrolle unterzogen.
Es handelt sich hierbei um Spül- und Abstrichproben des Absaug- Biopsiekanals sowie Abstrichproben vom Einführungsteil am Endoskop. Die Auswertung erfolgte nach 48 h Bebrütungszeit.