Die Regulation der Genexpression ist eine der faszinierendsten und komplexesten Aufgaben der Zelle. Die Forschungsprojekte in unserem Labor zielen darauf ab, die molekulare Funktion und die regulatorischen Prinzipien von nichtkodierenden RNAs (ncRNAs) und RNA-bindenden Proteinen (RBPs) in Krebszellen aufzudecken. Um dieses Ziel zu erreichen, entwickeln wir neuartige Strategien um Gene gezielt zu regulieren, die wir mit Methoden der klassischen Zellbiologie und Biochemie kombinieren, um molekulare Wege und Interaktionsnetzwerke dieser wichtigen Regulatoren im Kontext der Tumorbiologie, insbesondere bei der Metastasierung, zu analysieren. Letztendlich wollen wir Schwachstellen bei Krebserkrankungen beim Menschen identifizieren, die eine unausgewogene Expression von ncRNAs und RBPs aufweisen, wobei genetische Screening-Tools (z. B. CRISPR / Cas9) eingesetzt werden. Unsere Forschung zielt letztlich darauf ab therapeutische Zielstrukturen zu identifizieren und neue Behandlungsmöglichkeiten zu entwicklen.

Unsere Projekte

  1. Haemmerle, Gutschner et al. (2013) Posttranscriptional destabilization of the liver-specific long noncoding RNA HULC by the IGF2 mRNA-binding protein 1 (IGF2BP1).
  2. Gutschner, Haemmerle, Pazaitis et al. (2014) Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 (IGF2BP1) is an important protumorigenic factor in hepatocellular carcinoma.
  3. Nachmani, Gutschner et al. (2014) RNA-binding proteins regulate the expression of the immune activating ligand MICB.
  4. Weiße et al. (2020) RNA-Binding Proteins as Regulators of Migration, Invasion and Metastasis in Oral Squamous Cell Carcinoma.
  5. Neu et al. (2020) Post-Transcriptional Expression Control in Platelet Biogenesis and Function.
  1. Gutschner & Diederichs (2011) The hallmarks of cancer: a long non-coding RNA point of view.
  2. Gutschner et al. (2013) The noncoding RNA MALAT1 is a critical regulator of the metastasis phenotype of lung cancer cells.
  3. Gutschner et al. (2013) MALAT1 - a paradigm for long noncoding RNA function in cancer.
  4. Haemmerle & Gutschner (2015) Long non-coding RNAs in cancer and development: where do we go from here?
  5. Jacob et al. (2017) The Dark Side of the Epitranscriptome: Chemical Modifications in Long Non-Coding RNAs.
  6. Gutschner et al. (2018) From biomarkers to therapeutic targets-the promises and perils of long non-coding RNAs in cancer.
  7. Dorn et al. (2020) LINC00261 Is Differentially Expressed in Pancreatic Cancer Subtypes and Regulates a Pro-Epithelial Cell Identity.
  8. Glaß et al. (2020) Comprehensive Analysis of LincRNAs in Classical and Basal-Like Subtypes of Pancreatic Cancer.
  1. Weiße et al. (2021) Identification of lymphocyte cell-specific protein-tyrosine kinase (LCK) as a driver for invasion and migration of oral cancer by tumor heterogeneity exploitation.
  1. Gutschner et al. (2011) Noncoding RNA gene silencing through genomic integration of RNA destabilizing elements using zinc finger nucleases.
  2. Gutschner et al. (2013) The noncoding RNA MALAT1 is a critical regulator of the metastasis phenotype of lung cancer cells.
  3. Gutschner et al. (2016) Post-translational Regulation of Cas9 during G1 Enhances Homology-Directed Repair.

Forschungsförderung und Drittmittel

intramural

2017 – 2022: Wilhelm-Roux-Nachwuchsgruppe der Medizinischen Fakultät

extern

2020 - 2023: DFG
Projekt: Defining genetic interactions and dependencies of microRNA biogenesis factors

2018 – 2022: Carsten-Bender-Leukämie-Stiftung
Projekt: Identification of essential genes in leukemia cancer cells using CRISPR/Cas9  

2018 - 2021: Fonds der Chemischen Industrie (FCI)
Projekt: Chemical modifications in RNA - cellular function and clinical application 

 

Publikationen

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